21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3543 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3543  hypothetical protein  100 
 
 		 365 aa  716    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.571666  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72300  hypothetical protein  54.19 
 
 		 346 aa  368  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6275  hypothetical protein  54.49 
 
 		 340 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0120  hypothetical protein  54.83 
 
 		 395 aa  362  4e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0067  hypothetical protein  55.14 
 
 		 397 aa  359  3e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5084  hypothetical protein  52 
 
 		 340 aa  344  1e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0424557 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0161  hypothetical protein  52 
 
 		 341 aa  342  8e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.853384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0159  hypothetical protein  52.02 
 
 		 340 aa  342  8e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.860597 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0143  hypothetical protein  52.34 
 
 		 341 aa  341  9e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109428  normal  0.11094 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0036  hypothetical protein  50.16 
 
 		 342 aa  332  6e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326703  normal  0.177153 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2156  hypothetical protein  52.45 
 
 		 341 aa  327  3e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00627834  normal  0.0979823 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01770  hypothetical protein  57.5 
 
 		 337 aa  321  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2394  hypothetical protein  45.2 
 
 		 376 aa  265  8e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0953  hypothetical protein  32.76 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1796  hypothetical protein  29.57 
 
 		 137 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00914712  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2048  hypothetical protein  31.15 
 
 		 133 aa  50.4  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000179688  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2318  hypothetical protein  28.1 
 
 		 130 aa  48.9  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000668387  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0714  hypothetical protein  31.11 
 
 		 369 aa  47.8  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1528  hypothetical protein  25.64 
 
 		 135 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.238121  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2688  hypothetical protein  25.64 
 
 		 135 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000329796 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2488  hypothetical protein  25.9 
 
 		 131 aa  43.9  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.694196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>