17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0717 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0717  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 331 aa  668    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0730  type IV pilus assembly PilZ  93.05 
 
 		 331 aa  600  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000601574 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3923  type IV pilus assembly PilZ  42.6 
 
 		 395 aa  273  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279432  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1757  hypothetical protein  30.68 
 
 		 330 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.431367  normal  0.111889 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1766  type IV pilus assembly PilZ  26.3 
 
 		 381 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2187  type IV pilus assembly PilZ  27.7 
 
 		 351 aa  132  9e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1240  hypothetical protein  29.59 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0320  type IV pilus assembly PilZ  23.29 
 
 		 366 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0044  type IV pilus assembly PilZ  24.82 
 
 		 276 aa  96.3  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0347  type IV pilus assembly PilZ  26.23 
 
 		 329 aa  94  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.97543e-16 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0459  hypothetical protein  26.3 
 
 		 259 aa  92  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0366  type IV pilus assembly PilZ  25.18 
 
 		 329 aa  91.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4082  type IV pilus assembly PilZ  25.47 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3536  type IV pilus assembly PilZ  25.38 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3602  type IV pilus assembly PilZ  25 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3033  hypothetical protein  22.34 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0488  type IV pilus assembly PilZ  25.83 
 
 		 224 aa  47.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>