12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0515 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0515  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  649    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.312944  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0186  hypothetical protein  47.78 
 
 		 320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4225  hypothetical protein  44.68 
 
 		 139 aa  94  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0230  hypothetical protein  39.36 
 
 		 161 aa  81.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1288  hypothetical protein  39.53 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00224193  hitchhiker  0.00309833 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4071  hypothetical protein  52.83 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000117881  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1680  hypothetical protein  42 
 
 		 149 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07095  signal peptidase I  31.87 
 
 		 530 aa  58.9  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0686  hypothetical protein  32.74 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.596524  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0443  hypothetical protein  35.59 
 
 		 146 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.183489  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0206  signal peptidase I  29.76 
 
 		 517 aa  52.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1810  signal peptidase I  22.22 
 
 		 517 aa  48.9  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>