11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3409 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3409  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  139  9e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3502  hypothetical protein  71.83 
 
 		 72 aa  84  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2462  hypothetical protein  73.61 
 
 		 72 aa  83.6  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0597  hypothetical protein  48.61 
 
 		 80 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.607907  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2925  hypothetical protein  55.07 
 
 		 79 aa  53.9  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0581783  hitchhiker  0.000000000000134727 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2913  hypothetical protein  38.96 
 
 		 77 aa  50.4  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0380282 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1697  hypothetical protein  41.33 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1709  hypothetical protein  37.5 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.227987  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3648  hypothetical protein  50.72 
 
 		 82 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00133622  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3501  hypothetical protein  38.57 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2461  hypothetical protein  39.34 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>