14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2518 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2518  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  293  7e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.956557  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1262  rhodanese domain protein  54.41 
 
 		 141 aa  161  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2963  Rhodanese domain protein  52.9 
 
 		 140 aa  160  7e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1977  Rhodanese domain protein  46.43 
 
 		 138 aa  130  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.474064  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3866  Rhodanese domain protein  32.43 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.138224  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1048  rhodanese domain-containing protein  31.31 
 
 		 106 aa  45.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00818929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  31.67 
 
 		 127 aa  41.2  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  27.36 
 
 		 150 aa  41.2  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4128  Thiosulfate sulfurtransferase  27.88 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.801099  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5692  rhodanese domain-containing protein  28.74 
 
 		 221 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4110  Rhodanese domain protein  30.85 
 
 		 370 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5313  rhodanese-like protein  28.74 
 
 		 221 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5402  rhodanese domain-containing protein  28.74 
 
 		 221 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172427 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  27.72 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>