14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1252 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1252  hypothetical protein  100 
 
 		 1652 aa  3391    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109377  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3490  hypothetical protein  40.51 
 
 		 1970 aa  1221    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1975  hypothetical protein  40.93 
 
 		 1941 aa  1244    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.72197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2281  hypothetical protein  40.65 
 
 		 1945 aa  1243    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.434235 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2447  hypothetical protein  40.9 
 
 		 1944 aa  1237    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2456  hypothetical protein  40.47 
 
 		 1959 aa  1222    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2625  putative multicopper oxidase  36.06 
 
 		 1569 aa  887    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3666  putative multicopper oxidase  36.2 
 
 		 1581 aa  889    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3893  hypothetical protein  40.13 
 
 		 2016 aa  1249    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1068  putative multicopper oxidase  33.44 
 
 		 2493 aa  476  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0216732 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1576  hypothetical protein  26.29 
 
 		 1525 aa  195  6e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.480868 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3146  hypothetical protein  29.59 
 
 		 1476 aa  128  8.000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21180  predicted multicopper oxidase  28.79 
 
 		 334 aa  53.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.689075 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21170  predicted multicopper oxidase  26.04 
 
 		 318 aa  46.6  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.365675 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>