41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0848 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0848  ferredoxin family protein, putative  100 
 
 		 73 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3492  ferredoxin family protein, putative  76.71 
 
 		 73 aa  122  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0429  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  72.58 
 
 		 64 aa  101  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00643202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2919  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  69.35 
 
 		 63 aa  96.7  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.74825 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1365  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  69.35 
 
 		 63 aa  94  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0198  ferredoxin family protein, putative  66.13 
 
 		 64 aa  91.7  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0467  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  66.13 
 
 		 64 aa  87  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.915764  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3697  ferredoxin family protein, putative  63.49 
 
 		 64 aa  86.7  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3169  ferredoxin family protein, putative  56.45 
 
 		 64 aa  86.3  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1093  ferredoxin family protein, putative  56.45 
 
 		 64 aa  86.3  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0148  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  61.9 
 
 		 62 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3449  ferredoxin family protein, putative  60.32 
 
 		 62 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3187  ferredoxin family protein  59.68 
 
 		 63 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  59.68 
 
 		 63 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000199396  normal  0.668845 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1206  hypothetical protein  57.14 
 
 		 317 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3343  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  54.69 
 
 		 63 aa  73.9  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000237293  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3088  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  50 
 
 		 62 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1186  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  50 
 
 		 62 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.627413  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1625  ferredoxin family protein, putative  50 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.216587  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2497  hypothetical protein  45.16 
 
 		 66 aa  50.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000099072  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18761  hypothetical protein  36.23 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1007  ferredoxin  36.23 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0154  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  52.63 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286313 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16671  hypothetical protein  42.62 
 
 		 119 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15971  ferredoxin  38.36 
 
 		 128 aa  47.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2676  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.42 
 
 		 64 aa  47  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16791  hypothetical protein  40.98 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1570  hypothetical protein  42.62 
 
 		 119 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0286  ferredoxin II  43.94 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00127142  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1814  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.39 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0066  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain-containing protein  34.43 
 
 		 1655 aa  44.3  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_9697  predicted protein  34.85 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.012492  normal  0.333418 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16571  hypothetical protein  37.7 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.262713  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2578  hypothetical protein  39.34 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.390984  normal  0.110309 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1749  ferredoxin  35.21 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.855381 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2579  ferredoxin  34.43 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.698297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2933  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 64 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1897  ferredoxin  36.07 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7956  predicted protein  40.32 
 
 		 167 aa  40.4  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00346454  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1921  Ferredoxin-like protein  36.07 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.207385  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0839  Ferredoxin-like protein  32.79 
 
 		 156 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00930022 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>