17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3672 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3672  hypothetical protein  100 
 
 		 505 aa  1063    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4228  phage uncharacterized protein  27.69 
 
 		 594 aa  163  7e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.76146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0728  phage uncharacterized protein  27.67 
 
 		 558 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0432  phage uncharacterized protein  26.41 
 
 		 537 aa  153  8e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0249  phage uncharacterized protein  26.63 
 
 		 527 aa  151  2e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3908  phage uncharacterized protein  26.09 
 
 		 555 aa  143  9e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.40359 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2900  phage uncharacterized protein  28.64 
 
 		 556 aa  127  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280001  normal  0.181567 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4110  phage uncharacterized protein  27.5 
 
 		 556 aa  126  7e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000229879 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2384  phage protein  23.97 
 
 		 571 aa  107  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0266  hypothetical protein  24.09 
 
 		 500 aa  92.8  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1847  hypothetical protein  30.69 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00105061  normal  0.57122 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4168  hypothetical protein  29.49 
 
 		 612 aa  63.9  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0632962  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5343  phage uncharacterized protein  21 
 
 		 586 aa  57.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0014  hypothetical protein  26.46 
 
 		 484 aa  55.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2131  hypothetical protein  26.5 
 
 		 703 aa  55.1  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2556  Phage uncharacterized protein-like  22.77 
 
 		 505 aa  54.3  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3774  aldo/keto reductase  28.12 
 
 		 353 aa  43.1  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>