13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2131 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2131  hypothetical protein  100 
 
 		 703 aa  1463    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2900  phage uncharacterized protein  25.41 
 
 		 556 aa  91.7  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280001  normal  0.181567 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4110  phage uncharacterized protein  25.08 
 
 		 556 aa  90.9  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000229879 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0432  phage uncharacterized protein  26.54 
 
 		 537 aa  90.1  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0249  phage uncharacterized protein  24.79 
 
 		 527 aa  76.3  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0728  phage uncharacterized protein  25 
 
 		 558 aa  72  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4228  phage uncharacterized protein  23.06 
 
 		 594 aa  64.3  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.76146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1660  phage terminase GpA  29.68 
 
 		 680 aa  59.7  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.284129 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3672  hypothetical protein  26.5 
 
 		 505 aa  55.5  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6601  putative phage terminase large subunit  25.64 
 
 		 677 aa  54.7  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4146  terminase GpA  23.22 
 
 		 692 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2463  terminase GpA  22.26 
 
 		 690 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3908  phage uncharacterized protein  18.67 
 
 		 555 aa  48.9  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.40359 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>