15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2157 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2157  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 359 aa  729    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2059  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  90.28 
 
 		 360 aa  632  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2143  hypothetical protein  38.46 
 
 		 344 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0705369  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1834  hypothetical protein  38.95 
 
 		 339 aa  223  4e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.434531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1782  hypothetical protein  37.23 
 
 		 144 aa  82.4  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.92731  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 		 750 aa  58.5  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1955  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 311 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0490064  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2243  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 311 aa  50.8  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6122  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  30.07 
 
 		 4079 aa  49.7  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  30.37 
 
 		 321 aa  49.7  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0535  TPR repeat-containing protein  41.94 
 
 		 596 aa  46.6  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0120015  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  26.97 
 
 		 3301 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0786  TPR repeat-containing protein  34.65 
 
 		 364 aa  43.5  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.300568  hitchhiker  0.00289108 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1773  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 318 aa  43.9  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7075  TPR repeat-containing protein  35 
 
 		 609 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.986881 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>