13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1677 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2554  hypothetical protein  92.13 
 
 		 1131 aa  2082    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1677  hypothetical protein  100 
 
 		 1131 aa  2310    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0666  hypothetical protein  38.51 
 
 		 1193 aa  488  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.447807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1046  response regulator receiver /GGDEF/PAS/PAC domain-containing protein  32.89 
 
 		 895 aa  212  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3159  hypothetical protein  29.5 
 
 		 900 aa  204  6e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0980935  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3605  hypothetical protein  33.26 
 
 		 863 aa  199  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000881284 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5245  hypothetical protein  32.59 
 
 		 2204 aa  159  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.291359  hitchhiker  0.0000299325 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1083  hypothetical protein  27.02 
 
 		 831 aa  143  1.9999999999999998e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0364  hypothetical protein  26.96 
 
 		 821 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3932  hypothetical protein  25.68 
 
 		 921 aa  108  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0926169 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2998  hypothetical protein  23.87 
 
 		 906 aa  99.4  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0671  hypothetical protein  26.5 
 
 		 831 aa  92.4  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2457  hypothetical protein  27.37 
 
 		 866 aa  82  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0520379  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>