17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0347 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0347  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 329 aa  650    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.97543e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0366  type IV pilus assembly PilZ  96.66 
 
 		 329 aa  608  1e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1766  type IV pilus assembly PilZ  30.03 
 
 		 381 aa  166  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1757  hypothetical protein  32.33 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.431367  normal  0.111889 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2187  type IV pilus assembly PilZ  35.4 
 
 		 351 aa  145  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1240  hypothetical protein  32.93 
 
 		 332 aa  142  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0044  type IV pilus assembly PilZ  28.83 
 
 		 276 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0320  type IV pilus assembly PilZ  28.21 
 
 		 366 aa  106  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0717  type IV pilus assembly PilZ  25.83 
 
 		 331 aa  96.7  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0459  hypothetical protein  28.62 
 
 		 259 aa  95.1  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4082  type IV pilus assembly PilZ  27.17 
 
 		 264 aa  95.5  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3923  type IV pilus assembly PilZ  24.36 
 
 		 395 aa  92  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279432  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0730  type IV pilus assembly PilZ  25.9 
 
 		 331 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000601574 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3033  hypothetical protein  26.47 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3602  type IV pilus assembly PilZ  24.43 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3536  type IV pilus assembly PilZ  24.05 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0488  type IV pilus assembly PilZ  22.13 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>