38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6332 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6332    100 
 
 		 447 bp  886    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6212  transposase IS116/IS110/IS902  97.06 
 
 		 1263 bp  60  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4714  transposase IS116/IS110/IS902  97.06 
 
 		 1263 bp  60  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3689  transposase IS116/IS110/IS902  97.06 
 
 		 1263 bp  60  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.767433  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2654  transposase IS116/IS110/IS902  97.06 
 
 		 1263 bp  60  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2516  transposase IS116/IS110/IS902  97.06 
 
 		 1263 bp  60  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0354  transposase IS116/IS110/IS902  97.06 
 
 		 1263 bp  60  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.473452  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4744  transposase IS116/IS110/IS902  97.06 
 
 		 1263 bp  60  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1867  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  97.06 
 
 		 1263 bp  60  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3649  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  97.06 
 
 		 1263 bp  60  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.229157  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1982    90 
 
 		 261 bp  60  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268441  normal  0.248376 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1195  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  96.97 
 
 		 1263 bp  58  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0716  transposase IS116/IS110/IS902  96.97 
 
 		 1263 bp  58  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31796  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1285    87.72 
 
 		 192 bp  58  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.122916  hitchhiker  0.00261898 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3160  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 		 1200 bp  56  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846497  normal  0.201189 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2708    92.31 
 
 		 579 bp  54  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3480  putative transposase  92.31 
 
 		 1263 bp  54  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0156  putative transposase  92.31 
 
 		 1263 bp  54  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2763  putative transposase IS110  92.31 
 
 		 1263 bp  54  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1289  transposase  94.12 
 
 		 1263 bp  52  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0480    94.12 
 
 		 1224 bp  52  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1387  transposase  94.12 
 
 		 1263 bp  52  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0298    88 
 
 		 186 bp  52  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0391304 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3194  ISBma3, transposase  94.12 
 
 		 1263 bp  52  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2836  ISBma3, transposase  94.12 
 
 		 1263 bp  52  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1755  ISBma3, transposase  94.12 
 
 		 1263 bp  52  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00342149  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1754  ISBma3, transposase  94.12 
 
 		 1263 bp  52  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534372  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1545  ISBma3, transposase  94.12 
 
 		 1263 bp  52  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2615  transposase  94.12 
 
 		 1263 bp  52  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0243344  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1893  transposase  94.12 
 
 		 1281 bp  52  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0735  transposase  94.12 
 
 		 1263 bp  52  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0642  transposase  94.12 
 
 		 1263 bp  52  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1964  transposase  94.12 
 
 		 1263 bp  52  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1413    94.12 
 
 		 467 bp  52  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0576    93.94 
 
 		 1293 bp  50.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0983085  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7787    93.75 
 
 		 1261 bp  48.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.511104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0103  putative transposase  85.45 
 
 		 738 bp  46.1  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2759  hypothetical protein  93.55 
 
 		 582 bp  46.1  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.433498  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>