24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5474 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5474  putative oxygenase subunit protein  100 
 
 
408 aa  838    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3428  putative dehydrogenase/oxygenase subunit (flavoprotein)  60.1 
 
 
412 aa  497  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251863  normal  0.249872 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6307  hypothetical protein  54.05 
 
 
412 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.398194 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6011  hypothetical protein  54.3 
 
 
412 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.652248 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5487  hypothetical protein  53.32 
 
 
412 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.544992  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6773  hypothetical protein  53.32 
 
 
412 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.903776  normal  0.672585 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6361  hypothetical protein  53.32 
 
 
412 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2912  putative oxygenase subunit protein  55.93 
 
 
415 aa  451  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.69464 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7179  hypothetical protein  52.58 
 
 
412 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.055566 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1837  putative oxygenase subunit protein  51.59 
 
 
416 aa  437  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272624  normal  0.145679 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3319  putative oxygenase subunit protein  54.39 
 
 
413 aa  437  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0147948  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3469  putative oxygenase subunit protein  48.92 
 
 
429 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0690233  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1791  putative dehydrogenase/oxygenase subunit (flavoprotein)  49.65 
 
 
431 aa  384  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480723  normal  0.833555 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2850  putative oxygenase subunit protein  47.09 
 
 
421 aa  364  1e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1344  putative oxygenase  45.7 
 
 
413 aa  347  2e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00629654  hitchhiker  0.0000135484 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0493  putative oxygenase subunit protein  42.58 
 
 
418 aa  318  1e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0853  putative oxygenase subunit protein  38.24 
 
 
417 aa  291  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33980  oxygenase subunit protein  38.21 
 
 
405 aa  249  5e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5734  hypothetical protein  33.49 
 
 
413 aa  203  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.422452  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6219  putative oxidoreductase  30.77 
 
 
461 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4509  FAD dependent oxidoreductase  28.75 
 
 
416 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.014564  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4435  putative monooxygenase  30.2 
 
 
415 aa  149  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.975242  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2115  monooxygenase  27.02 
 
 
435 aa  115  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.827363  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4329  hypothetical protein  26.84 
 
 
463 aa  113  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>