10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5453 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5453  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  351  4e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2500  hypothetical protein  33.56 
 
 		 369 aa  76.3  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000111187 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4406  hypothetical protein  30.3 
 
 		 367 aa  64.7  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2245  hypothetical protein  25.27 
 
 		 363 aa  55.8  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3975  hypothetical protein  28.8 
 
 		 361 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2219  hypothetical protein  42.11 
 
 		 363 aa  52.4  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7978  hypothetical protein  37.18 
 
 		 376 aa  52.4  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1868  hypothetical protein  35 
 
 		 371 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4498  hypothetical protein  32.91 
 
 		 371 aa  42  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13190  hypothetical protein  34.18 
 
 		 374 aa  41.2  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.269746 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>