25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3968 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3968  phosphopantetheine-binding  100 
 
 
87 aa  161  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0123563  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1927  phosphopantetheine-binding  56.98 
 
 
86 aa  88.2  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4171  phosphopantetheine-binding  55.56 
 
 
85 aa  86.7  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3505  phosphopantetheine-binding  43.64 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.821784  normal  0.0108051 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3460  acyl carrier protein  31.08 
 
 
81 aa  45.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712705 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2874  acyl carrier protein  32.39 
 
 
78 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0334524  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3247  acyl carrier protein  32.39 
 
 
78 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  31.58 
 
 
80 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  31.58 
 
 
80 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  30.67 
 
 
80 aa  43.5  0.0009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  30.67 
 
 
80 aa  43.5  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1416  acyl carrier protein  32.84 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.28944  normal  0.571191 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  30.99 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3176  hypothetical protein  25.32 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  30.67 
 
 
103 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  32.88 
 
 
78 aa  41.6  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  30.99 
 
 
3101 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17961  acyl carrier protein  28 
 
 
80 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0258441  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2493  acyl carrier protein  27.27 
 
 
78 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9709  predicted protein  32.35 
 
 
71 aa  40.8  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.14468  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  30.56 
 
 
82 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3256  acyl carrier protein  31.94 
 
 
82 aa  40.8  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.929714  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18011  acyl carrier protein  28 
 
 
79 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18181  acyl carrier protein  28 
 
 
79 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0536  acyl carrier protein  28.38 
 
 
80 aa  40.4  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75126  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>