11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2598 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2598  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  421  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1740  hypothetical protein  58.43 
 
 
208 aa  202  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0509765  normal  0.138367 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2798  hypothetical protein  51.79 
 
 
202 aa  190  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1785  hypothetical protein  50.74 
 
 
201 aa  187  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0362351 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2697  hypothetical protein  53.16 
 
 
167 aa  128  7.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.767882 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8602  hypothetical protein  34.31 
 
 
197 aa  87.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224989  normal  0.300454 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6898  hypothetical protein  33.09 
 
 
192 aa  75.1  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.119426  normal  0.193827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4027  hypothetical protein  32 
 
 
209 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148994  hitchhiker  0.00308496 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4461  hypothetical protein  36.15 
 
 
188 aa  65.1  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.115228 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4974  hypothetical protein  34.62 
 
 
185 aa  62.4  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1219  hypothetical protein  32.85 
 
 
182 aa  55.1  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00390596 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>