11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1219 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1219  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  349  8.999999999999999e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00390596 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2598  hypothetical protein  32.35 
 
 		 211 aa  71.2  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1740  hypothetical protein  35.03 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0509765  normal  0.138367 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1785  hypothetical protein  30.93 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0362351 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2798  hypothetical protein  34.48 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8602  hypothetical protein  29.32 
 
 		 197 aa  51.6  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224989  normal  0.300454 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4027  hypothetical protein  29.71 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148994  hitchhiker  0.00308496 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2697  hypothetical protein  31.47 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.767882 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4461  hypothetical protein  30.88 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.115228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6898  hypothetical protein  30.34 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.119426  normal  0.193827 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4974  hypothetical protein  30.83 
 
 		 185 aa  42.4  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>