12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1740 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1740  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  419  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0509765  normal  0.138367 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2598  hypothetical protein  55.92 
 
 		 211 aa  218  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2798  hypothetical protein  54.19 
 
 		 202 aa  212  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1785  hypothetical protein  56.76 
 
 		 201 aa  202  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0362351 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2697  hypothetical protein  56.85 
 
 		 167 aa  142  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.767882 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6898  hypothetical protein  38.06 
 
 		 192 aa  94  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.119426  normal  0.193827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8602  hypothetical protein  34.2 
 
 		 197 aa  89  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224989  normal  0.300454 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4027  hypothetical protein  25.15 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148994  hitchhiker  0.00308496 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1219  hypothetical protein  36.64 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00390596 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4461  hypothetical protein  31.67 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.115228 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4974  hypothetical protein  30.65 
 
 		 185 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2231  hypothetical protein  26.7 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.500037  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>