24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1996 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1996  alpha/beta hydrolase  100 
 
 
138 aa  279  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113138  normal  0.051716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4090  alpha/beta hydrolase  51.67 
 
 
121 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2728  alpha/beta hydrolase  54.05 
 
 
125 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0691218  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5596  alpha/beta hydrolase  44.35 
 
 
123 aa  101  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5749  Alpha/beta hydrolase  49.52 
 
 
408 aa  93.2  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.03491  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1810  alpha/beta hydrolase fold  45.38 
 
 
408 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.424856  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2422  alpha/beta hydrolase fold  45.38 
 
 
408 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00445003  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2426  alpha/beta hydrolase fold  44.54 
 
 
408 aa  90.5  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.278939 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5567  hypothetical protein  37.39 
 
 
119 aa  78.2  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1791  hypothetical protein  35.96 
 
 
121 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2427  hypothetical protein  33.65 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0157231  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0510  hypothetical protein  45.24 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2493  hypothetical protein  33.65 
 
 
122 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000216292  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2533  hypothetical protein  35.05 
 
 
122 aa  72  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2781  hypothetical protein  35.05 
 
 
122 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.692252  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2732  hypothetical protein  35.05 
 
 
122 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.27725e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2719  hypothetical protein  35.05 
 
 
122 aa  72  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.584026  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2737  hypothetical protein  35.05 
 
 
122 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2565  hypothetical protein  34.02 
 
 
122 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806196 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0670  hypothetical protein  30.77 
 
 
119 aa  69.7  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3597  hypothetical protein  37.63 
 
 
118 aa  67.8  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0838  transcriptional regulator, PadR-like family  33.73 
 
 
305 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3110  transcriptional regulator, PadR-like family  42.42 
 
 
325 aa  52.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271029  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3077  hypothetical protein  35.53 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0824454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>