16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1129 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1129  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  347  4e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3610  hypothetical protein  61.18 
 
 
204 aa  161  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0641  hypothetical protein  33.33 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3290  hypothetical protein  35.34 
 
 
174 aa  55.1  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.165615  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1486  hypothetical protein  35.76 
 
 
191 aa  54.7  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0685167  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2791  hypothetical protein  28.57 
 
 
145 aa  51.6  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.688451  normal  0.192686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8007  hypothetical protein  33.62 
 
 
145 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3445  hypothetical protein  33.62 
 
 
141 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.815991  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2149  hypothetical protein  39.77 
 
 
207 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10780  hypothetical protein  30.77 
 
 
166 aa  46.2  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.727919  normal  0.390752 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0202  hypothetical protein  34.38 
 
 
155 aa  44.3  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4218  hypothetical protein  37.21 
 
 
200 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19108  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5987  hypothetical protein  37.76 
 
 
180 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8040  hypothetical protein  32.85 
 
 
168 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4042  hypothetical protein  34.26 
 
 
180 aa  41.6  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.119824  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12995  hypothetical protein  34.78 
 
 
181 aa  40.8  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00625198  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>