15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0878 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0878  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  392  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3838  hypothetical protein  75.95 
 
 
140 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0245433 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06340  hypothetical protein  39.24 
 
 
104 aa  59.3  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0650  hypothetical protein  41.18 
 
 
167 aa  59.3  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192275  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2146  hypothetical protein  39.53 
 
 
126 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00360758  hitchhiker  0.00871202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0779  hypothetical protein  43.06 
 
 
191 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1838  hypothetical protein  48.28 
 
 
179 aa  50.4  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.450169  normal  0.227053 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1202  hypothetical protein  43.06 
 
 
100 aa  50.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1171  DivIVA domain protein  41.03 
 
 
106 aa  49.7  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0703  hypothetical protein  40.26 
 
 
214 aa  48.5  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.388175 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3309  DivIVA domain protein  46.43 
 
 
148 aa  48.5  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7945  hypothetical protein  38.37 
 
 
185 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1095  DivIVA domain protein  40.85 
 
 
125 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423164  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11233  hypothetical protein  40 
 
 
122 aa  42  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155825  normal  0.0761739 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0698  hypothetical protein  27.91 
 
 
141 aa  42  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>