46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3513 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3513  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
174 aa  350  5.9999999999999994e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0738114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5397  hypothetical protein  67.65 
 
 
153 aa  193  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15934  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17360  Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily  65.12 
 
 
130 aa  164  5e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.1734  normal  0.0877345 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3492  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  67.72 
 
 
133 aa  161  4.0000000000000004e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.81151  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4085  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.8 
 
 
126 aa  140  8e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0088238  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2687  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.49 
 
 
131 aa  131  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.967274  normal  0.218251 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0469  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.35 
 
 
145 aa  129  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2897  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.98 
 
 
148 aa  128  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2681  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.03 
 
 
121 aa  125  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000007341  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3317  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.88 
 
 
137 aa  105  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.688125  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5329  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.8 
 
 
127 aa  101  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.510874 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2493  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.07 
 
 
130 aa  54.7  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000450738  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3001  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35 
 
 
139 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5734  hypothetical protein  33.07 
 
 
120 aa  51.2  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0632882  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1109  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.36 
 
 
132 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1476  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.96 
 
 
211 aa  50.1  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2591  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.5 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0328  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.23 
 
 
143 aa  48.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0643215  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3912  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.82 
 
 
141 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.24051  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2982  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.08 
 
 
144 aa  45.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4303  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.03 
 
 
132 aa  44.7  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.477386 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1470  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.83 
 
 
124 aa  44.7  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.22177 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3175  hypothetical protein  31.06 
 
 
141 aa  44.7  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.798678  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2842  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.86 
 
 
143 aa  44.7  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6552  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.78 
 
 
145 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2449  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6284  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.89 
 
 
145 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0511658  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2762  hypothetical protein  32.17 
 
 
141 aa  43.9  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164175  normal  0.493931 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3856  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.55 
 
 
128 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.207076  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1708  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.5 
 
 
141 aa  43.5  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.129026 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1773  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.78 
 
 
143 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.243786  normal  0.593439 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4456  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.85 
 
 
137 aa  43.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0005  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.97 
 
 
140 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000237771 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3933  hypothetical protein  31.25 
 
 
141 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00670375  normal  0.940576 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1871  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.85 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.185318 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2051  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.5 
 
 
140 aa  42.4  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.622827  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58620  hypothetical protein  29.77 
 
 
141 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0631  hypothetical protein  29.75 
 
 
132 aa  41.6  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.320962  normal  0.0102105 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2809  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.83 
 
 
127 aa  41.6  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.250629  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4162  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.03 
 
 
141 aa  41.6  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.986059  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3695  putative glyoxalase/Bleomycin resistance protein  40 
 
 
141 aa  41.6  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.948806  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3010  glyoxalase family protein  25 
 
 
127 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2905  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.9 
 
 
129 aa  41.2  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3047  glyoxalase family protein  24.17 
 
 
127 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.144066  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4066  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.61 
 
 
136 aa  40.8  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.32661 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3046  glyoxalase family protein  24.17 
 
 
127 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.242362  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1057  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.23 
 
 
133 aa  40.8  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>