14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2841 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2841  zeta toxin  100 
 
 		 450 aa  907    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.21799 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47232  predicted protein  23.2 
 
 		 492 aa  61.2  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.714654  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4239  zeta toxin family protein  26.39 
 
 		 560 aa  60.1  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1982  hypothetical protein  23.65 
 
 		 217 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000196874  normal  0.0213988 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2231  hypothetical protein  26.86 
 
 		 233 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.518522 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6819  zeta toxin family protein  21.5 
 
 		 659 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5016  zeta toxin family protein  25.35 
 
 		 365 aa  49.3  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1154  hypothetical protein  22.62 
 
 		 622 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.170278  normal  0.667092 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3021  ATPase, zeta toxin  30.61 
 
 		 333 aa  46.2  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03110  Zeta toxin  26.29 
 
 		 239 aa  46.2  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.562718  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1513  conserved hypothetical protein-like protein  27.27 
 
 		 212 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4476  hypothetical protein  24.24 
 
 		 247 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1093  hypothetical protein  35.92 
 
 		 205 aa  44.3  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.286623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0158  zeta toxin superfamily protein  22.78 
 
 		 294 aa  43.9  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00432306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>