15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1093 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1093  hypothetical protein  100 
 
 
228 aa  458  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12332  hypothetical protein  32.02 
 
 
238 aa  95.1  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0930  hypothetical protein  31.67 
 
 
230 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0955  hypothetical protein  30.43 
 
 
239 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.494066 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3199  hypothetical protein  31 
 
 
233 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000115841  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3249  hypothetical protein  27.9 
 
 
239 aa  72  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000723413  normal  0.230465 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1189  hypothetical protein  26.79 
 
 
233 aa  62.4  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2025  hypothetical protein  27.85 
 
 
240 aa  61.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117838  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2092  hypothetical protein  28.57 
 
 
231 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12053  hypothetical protein  28.17 
 
 
239 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9124  hypothetical protein  26.03 
 
 
241 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.55888  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5393  hypothetical protein  23.77 
 
 
221 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0264065 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0463  hypothetical protein  26.27 
 
 
224 aa  47  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.841772  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1135  hypothetical protein  49.02 
 
 
56 aa  45.4  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8602  hypothetical protein  22.77 
 
 
239 aa  43.5  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0242507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>