31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0445 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0445  thiamine S  100 
 
 		 97 aa  189  9e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2024  thiamineS protein  58.54 
 
 		 92 aa  88.6  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.930246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6174  thiamineS protein  64.29 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.156031 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4239  thiamineS protein  50.56 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.312253  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0596  thiamineS protein  51.19 
 
 		 84 aa  68.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0896  molybdopterin converting factor, subunit 1  52.94 
 
 		 83 aa  67  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2736  putative molybdopterin converting factor  50 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8251  thiamineS protein  55.7 
 
 		 83 aa  65.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0454  thiamineS protein  51.19 
 
 		 82 aa  64.3  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132954  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4962  thiamineS protein  48.19 
 
 		 82 aa  61.6  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.806952  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0470  thiamineS protein  42.22 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4752  thiamineS protein  41.49 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4375  thiamineS protein  48.24 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1704  thiamineS protein  49.41 
 
 		 82 aa  47  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1691  thiamineS protein  38.61 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.319795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34170  molybdopterin converting factor, small subunit  39.56 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.176144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1835  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.82 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0948  thiamineS protein  38.55 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1754  thiamineS protein  44.05 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.593582  hitchhiker  0.00626115 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19310  molybdopterin converting factor, small subunit  43.04 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0344734  normal  0.0247998 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20020  hypothetical protein  33.33 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891223 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4478  thiamineS  42.05 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.605033  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4565  thiamineS protein  42.05 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0626393 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4861  thiamineS protein  42.05 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0539176 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10885  molybdenum cofactor biosynthesis protein D 2 moaD2  44 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.91513e-26  normal  0.142298 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5048  thiamineS protein  40.82 
 
 		 88 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.501283  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0822  thiamineS protein  42.68 
 
 		 79 aa  41.6  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0182275  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5047  thiamineS protein  37.14 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0107855 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1916  molybdopterin converting factor, subunit 1  41.18 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1180  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.24 
 
 		 217 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2194  molybdopterin synthase subunit MoaD  38.1 
 
 		 83 aa  40  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000704898  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>