34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0292 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0292  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  431  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6520  hypothetical protein  59.21 
 
 		 240 aa  254  8e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.223836  normal  0.0543517 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1443  hypothetical protein  44.29 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.210948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3408  hypothetical protein  42.51 
 
 		 209 aa  142  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2240  hypothetical protein  40.95 
 
 		 209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.168407  normal  0.37732 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4607  hypothetical protein  41.83 
 
 		 210 aa  135  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0303145  hitchhiker  0.0000208711 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5808  hypothetical protein  42.86 
 
 		 206 aa  132  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3035  hypothetical protein  41.78 
 
 		 210 aa  131  9e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2927  hypothetical protein  39.71 
 
 		 210 aa  129  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.549173 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1677  hypothetical protein  39.71 
 
 		 220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.47521e-17 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0452  hypothetical protein  37.5 
 
 		 205 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0463  hypothetical protein  37.5 
 
 		 205 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.78842 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1682  hypothetical protein  38.28 
 
 		 214 aa  124  7e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.087821  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2970  hypothetical protein  39.13 
 
 		 238 aa  124  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0094971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0865  hypothetical protein  44.32 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.642531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0439  hypothetical protein  36.54 
 
 		 205 aa  121  8e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.471698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3229  hypothetical protein  39.11 
 
 		 207 aa  116  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12830  conserved hypothetical protein TIGR03085  39.05 
 
 		 248 aa  114  7.999999999999999e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.213535  normal  0.0190582 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3182  hypothetical protein  39.23 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.429032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0630  hypothetical protein  36.23 
 
 		 207 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2192  hypothetical protein  37.8 
 
 		 210 aa  113  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3980  hypothetical protein  41.54 
 
 		 203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1770  hypothetical protein  39.3 
 
 		 205 aa  108  8.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.92711  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11958  hypothetical protein  40.56 
 
 		 214 aa  103  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0608324  normal  0.971894 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0267  hypothetical protein  33.33 
 
 		 207 aa  102  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20820  conserved hypothetical protein TIGR03085  34.76 
 
 		 214 aa  98.2  8e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.395226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2229  hypothetical protein  36.63 
 
 		 207 aa  95.5  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1996  hypothetical protein  35.27 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10040  hypothetical protein  36.27 
 
 		 211 aa  85.1  8e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0305113  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15570  conserved hypothetical protein TIGR03085  35.32 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1129  hypothetical protein  29.49 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05210  hypothetical protein  36.36 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1697  hypothetical protein  33.02 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.942057  normal  0.254485 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3528  hypothetical protein  33.9 
 
 		 212 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.972653 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>