13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0727 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_0727  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  277  4e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0723  conserved hypothetical protein  93.01 
 
 		 1520 aa  161  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3251  hypothetical protein  93.01 
 
 		 1518 aa  161  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02842  predicted inner membrane lipoprotein  88.11 
 
 		 1517 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00831057  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02792  hypothetical protein  88.11 
 
 		 1517 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00846982  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3142  hypothetical protein  91.41 
 
 		 1503 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3432  hypothetical protein  90.76 
 
 		 1506 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 755 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  64.1 
 
 		 268 aa  45.1  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1599  Arylsulfotransferase  36.25 
 
 		 562 aa  42.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1386  hypothetical protein  42.86 
 
 		 529 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257961  normal  0.650962 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1631  sporulation domain-containing protein  48.94 
 
 		 525 aa  41.6  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  53.33 
 
 		 444 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>