20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3671 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3671  PilN family protein  100 
 
 		 179 aa  352  2e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000206166  normal  0.11524 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0319  Fimbrial assembly family protein  95.53 
 
 		 179 aa  290  1e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0816995  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03198  hypothetical protein  95.53 
 
 		 179 aa  290  1e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0290393  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3771  PilN family protein  95.53 
 
 		 179 aa  290  1e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0239021  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3865  PilN family protein  95.53 
 
 		 179 aa  290  1e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0528585  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03246  predicted fimbrial assembly protein  95.53 
 
 		 179 aa  290  1e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0184344  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4699  PilN family protein  95.53 
 
 		 179 aa  283  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0166356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3589  PilN family protein  94.97 
 
 		 179 aa  278  4e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00572766  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0319  fimbrial assembly family protein  94.97 
 
 		 179 aa  278  4e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.139922  normal  0.0971984 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3690  PilN family protein  49.16 
 
 		 179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.794853  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3797  PilN family protein  49.72 
 
 		 179 aa  138  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.416536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3860  PilN family protein  49.72 
 
 		 179 aa  138  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.793457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3763  PilN family protein  49.16 
 
 		 179 aa  137  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.196896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3688  PilN family protein  48.6 
 
 		 179 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.483537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3807  fimbrial assembly family protein  35.71 
 
 		 172 aa  94  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3970  fimbrial assembly protein PilN  29.63 
 
 		 201 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3731  hypothetical protein  29.63 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.23548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0221  fimbrial assembly family protein  29.63 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.632717  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3887  Fimbrial assembly family protein  29.61 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.412256  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0670  fimbrial assembly  19.89 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>