12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3333 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_3333  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  267  4e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2131  hypothetical protein  88.98 
 
 
130 aa  239  7e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01907  conserved hypothetical protein  92.56 
 
 
144 aa  239  7.999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01894  hypothetical protein  92.56 
 
 
133 aa  238  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0343  hypothetical protein  86.61 
 
 
127 aa  235  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.103903  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0473  hypothetical protein  68.09 
 
 
60 aa  74.3  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2128  hypothetical protein  34.15 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1078  hypothetical protein  33.06 
 
 
135 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.579163 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4883  hypothetical protein  33.05 
 
 
144 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1392  hypothetical protein  30.58 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0342  hypothetical protein  28.57 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0556448  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3332  hypothetical protein  27.73 
 
 
141 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>