51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2218 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_2218  phage baseplate assembly protein V  100 
 
 
301 aa  616  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.033632  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4849  phage baseplate assembly protein V  32 
 
 
210 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0194  phage baseplate assembly protein V  31.1 
 
 
234 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.263934 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01346  phage-related baseplate protein  32.45 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.261049  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3300  phage baseplate assembly protein V  34.44 
 
 
217 aa  80.5  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1337  hypothetical protein  30.77 
 
 
226 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.19388  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37480  Phage P2 baseplate assembly gpV-like protein  31.93 
 
 
180 aa  78.2  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1827  phage baseplate assembly protein V  29.82 
 
 
217 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0087576  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4337  phage baseplate assembly protein GpV  36.44 
 
 
211 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0120707 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1204  phage baseplate assembly protein V  32.89 
 
 
193 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690633 
 
 
-
 
NC_002978  WD0642  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein V  26.17 
 
 
154 aa  70.1  0.00000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.392908  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1925  phage baseplate assembly-like protein  32.72 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.405057 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1294  phage baseplate assembly protein V  40.22 
 
 
125 aa  68.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.455231 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2652  phage baseplate assembly protein V  33.33 
 
 
194 aa  68.6  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0950236  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4377  baseplate assembly protein V  33.33 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000317032 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3403  baseplate assembly protein V  33.59 
 
 
187 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3039  phage baseplate assembly protein GpV  33.9 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000239621 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4046  phage baseplate assembly protein V  31.16 
 
 
186 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000659846  hitchhiker  0.000000000000714572 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0869  phage baseplate assembly protein V  30.83 
 
 
211 aa  66.6  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0625663 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3187  phage baseplate assembly protein V  30.77 
 
 
213 aa  66.2  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.701564  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2341  phage baseplate assembly protein V  32 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.962217  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3488  phage baseplate assembly protein V  32.17 
 
 
213 aa  65.1  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0856237 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3051  pyocin R2_PP  28.91 
 
 
200 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1388  Phage-related baseplate assembly protein V  31.06 
 
 
221 aa  63.9  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.595566  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2090  phage baseplate assembly protein V  28.81 
 
 
213 aa  62  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.041892  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3037  phage baseplate assembly protein V  26.32 
 
 
192 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000236294 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2854  phage baseplate assembly protein V  28.48 
 
 
192 aa  59.3  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01988  hypothetical protein  25.6 
 
 
212 aa  59.3  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1868  phage baseplate assembly protein V  29.68 
 
 
226 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2765  phage baseplate assembly protein V  25.58 
 
 
192 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000252262 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0936  phage baseplate assembly protein V  24.26 
 
 
192 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1937  baseplate assembly protein V  29.41 
 
 
193 aa  54.3  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0406  phage-related baseplate assembly protein  28.95 
 
 
195 aa  53.5  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1145  phage-related baseplate assembly protein  28.95 
 
 
195 aa  53.5  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0760  hypothetical protein  28.06 
 
 
185 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0803813  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2902  phage baseplate assembly protein V  30.71 
 
 
202 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00847  hypothetical protein  24.26 
 
 
192 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00841  hypothetical protein  25.83 
 
 
273 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08010  hypothetical protein  29.93 
 
 
185 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000196385  hitchhiker  0.000218842 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1165  phage baseplate assembly protein V  28.07 
 
 
195 aa  52  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0364  phage baseplate assembly protein V  28.07 
 
 
195 aa  52  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2603  phage baseplate assembly protein V  35.56 
 
 
217 aa  50.4  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0154554  hitchhiker  0.000000000000278565 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2637  phage baseplate assembly protein V  35.56 
 
 
241 aa  50.4  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616276  hitchhiker  0.000571581 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0738  Phage baseplate assembly protein V  22.49 
 
 
186 aa  48.1  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2296  baseplate assembly protein V  36.23 
 
 
119 aa  47  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107943  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2889  phage baseplate assembly protein V  26.43 
 
 
193 aa  46.6  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2069  hypothetical protein  36.23 
 
 
84 aa  46.2  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000543099  hitchhiker  0.0000457319 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2183  baseplate assembly protein V, truncation  36.23 
 
 
84 aa  46.2  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1573  phage baseplate assembly protein V  25.71 
 
 
193 aa  45.8  0.0009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.551367  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3822  phage baseplate assembly protein V  25 
 
 
193 aa  45.8  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0893  phage baseplate assembly protein V  25.22 
 
 
196 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.176645  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>