28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1046 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_1046  phage baseplate assembly protein V  100 
 
 
197 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2700  prophage MuSo2, baseplate assembly protein V  37.38 
 
 
215 aa  132  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3735  Phage-related baseplate assembly protein V  37.06 
 
 
193 aa  115  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0694  bacteriophage Mu Gp45 protein  37.82 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0743  bacteriophage Mu Gp45 protein  37.82 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1814  putative phage baseplate assembly protein  43.61 
 
 
172 aa  104  8e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1160  Phage baseplate assembly protein V  34.46 
 
 
169 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3862  phage assembly protein, putative  36.59 
 
 
166 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4589  Phage baseplate assembly protein V  34.07 
 
 
170 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0187  phage baseplate assembly protein V  33.52 
 
 
216 aa  84.7  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0746  phage baseplate assembly protein V  27.94 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1872  phage baseplate assembly protein V  31.85 
 
 
199 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000459886 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4479  bacteriophage Mu Gp45 protein  38.61 
 
 
177 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023741 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2250  bacteriophage Mu Gp45 protein  38.61 
 
 
177 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.217214 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2253  bacteriophage Mu Gp45 protein  38.78 
 
 
177 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000590369 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2586  phage baseplate assembly protein V  38.1 
 
 
180 aa  72  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0640174 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2086  bacteriophage Mu Gp45 protein  27.63 
 
 
193 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3049  putative baseplate assembly protein Gp45,Mu-like  29 
 
 
175 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000179717 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2813  phage baseplate assembly protein V  27.7 
 
 
198 aa  52.4  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2735  phage baseplate assembly protein  27.7 
 
 
198 aa  52.4  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1471  phage baseplate assembly protein  27.7 
 
 
198 aa  51.6  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.388674 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4484  Mu-like prophage protein gp45-like protein  25.62 
 
 
185 aa  49.3  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124084 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3300  phage baseplate assembly protein V  26.79 
 
 
217 aa  45.4  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6585  putative bacteriophage protein, gp45-like protein  27.15 
 
 
172 aa  45.1  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0893  phage baseplate assembly protein V  27.52 
 
 
196 aa  45.1  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.176645  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4337  phage baseplate assembly protein GpV  27.67 
 
 
211 aa  43.5  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0120707 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4849  phage baseplate assembly protein V  27.18 
 
 
210 aa  42.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3039  phage baseplate assembly protein GpV  27.67 
 
 
211 aa  43.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000239621 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>