157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1343 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1343  Colicin V production protein  100 
 
 		 162 aa  318  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0732005  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2691  colicin V production protein  100 
 
 		 162 aa  318  1.9999999999999998e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02238  membrane protein required for colicin V production  99.38 
 
 		 162 aa  314  4e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1339  colicin V production protein  99.38 
 
 		 162 aa  314  4e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02198  hypothetical protein  99.38 
 
 		 162 aa  314  4e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2464  colicin V production protein  99.38 
 
 		 162 aa  314  4e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2607  colicin V production protein  99.38 
 
 		 162 aa  314  4e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2469  colicin V production protein  99.38 
 
 		 162 aa  314  4e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3453  colicin V production protein  98.77 
 
 		 162 aa  310  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2551  colicin V production protein  96.27 
 
 		 162 aa  306  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2605  colicin V production protein  96.27 
 
 		 162 aa  306  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.685477 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2505  colicin V production protein  96.27 
 
 		 162 aa  306  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2593  colicin V production protein  96.27 
 
 		 162 aa  306  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.272788  normal  0.627447 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2714  colicin V production protein  96.27 
 
 		 162 aa  306  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2862  colicin V production protein  93.79 
 
 		 162 aa  301  3.0000000000000004e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.488852  normal  0.252984 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3329  colicin V production protein  86.25 
 
 		 166 aa  276  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1470  colicin V production protein  81.99 
 
 		 166 aa  272  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2571  colicin V production protein  80.12 
 
 		 163 aa  271  3e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1373  colicin V production protein  81.99 
 
 		 163 aa  271  3e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2794  colicin V production protein  81.37 
 
 		 166 aa  270  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1534  colicin V production protein  82.61 
 
 		 169 aa  270  6e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.452834  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0356  colicin V production protein  82.61 
 
 		 169 aa  270  6e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1425  colicin V production protein  82.61 
 
 		 169 aa  270  6e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2303  colicin V production protein  68.32 
 
 		 162 aa  231  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2981  colicin V production protein  65.22 
 
 		 162 aa  226  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259461  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1655  colicin V production protein  63.35 
 
 		 162 aa  224  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00513231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1079  colicin V production protein (protein DedE)  67.28 
 
 		 163 aa  223  6e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1620  colicin V production protein  62.73 
 
 		 162 aa  220  6e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2147  colicin V production protein  60.87 
 
 		 162 aa  214  5e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.936952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002878  colicin V production protein  64.15 
 
 		 163 aa  212  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2739  colicin V production protein  60.87 
 
 		 162 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1620  Colicin V production protein  60.87 
 
 		 162 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0904729  normal  0.930325 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2756  colicin V production protein  60.87 
 
 		 162 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03096  hypothetical protein  62.89 
 
 		 163 aa  211  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1482  colicin V production protein  60.87 
 
 		 162 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.842254 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3065  colicin V production protein  60.25 
 
 		 162 aa  210  5.999999999999999e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1429  colicin V production protein  60.87 
 
 		 162 aa  210  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.550584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1494  colicin V production protein  60.87 
 
 		 162 aa  210  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2438  colicin V production protein  60.87 
 
 		 162 aa  210  5.999999999999999e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2833  colicin V production protein  60.25 
 
 		 162 aa  210  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.021527 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1489  colicin V production protein  61.49 
 
 		 166 aa  209  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000231949  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1398  colicin V production protein  60.87 
 
 		 162 aa  209  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0524  bacteriocin production protein  62.96 
 
 		 163 aa  207  4e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00361211  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3799  colicin V production protein  59.75 
 
 		 160 aa  201  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1608  colicin V production protein  58.49 
 
 		 162 aa  197  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1966  colicin V production protein  55.9 
 
 		 166 aa  194  3e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.530952 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0917  colicin V production protein  58.7 
 
 		 166 aa  175  2e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0367  CvpA family protein  51.59 
 
 		 161 aa  151  2.9999999999999998e-36  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.202665  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2073  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 component  48.59 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.576692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1560  colicin V production protein  50 
 
 		 185 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.328677  normal  0.213335 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1258  Colicin V production protein  48.95 
 
 		 162 aa  120  9e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3762  colicin V production protein  49.64 
 
 		 185 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1999  colicin V production protein  49.64 
 
 		 185 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1533  colicin V production protein  49.64 
 
 		 185 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1553  colicin V production protein  48.28 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0745627  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2712  colicin V production protein  52.14 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240429  normal  0.143429 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1329  Colicin V production protein  43.59 
 
 		 192 aa  114  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0804105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2047  colicin V production protein  44.17 
 
 		 177 aa  113  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.220439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34160  Colicin V production protein  49.29 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3812  cvpA family protein  45.32 
 
 		 195 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1667  colicin V production protein  45.32 
 
 		 195 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1298  hypothetical protein  37.91 
 
 		 177 aa  103  9e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1297  hypothetical protein  37.91 
 
 		 177 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23900  hypothetical protein  44.29 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00157781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2024  hypothetical protein  44.29 
 
 		 184 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2490  CvpA family protein  39.72 
 
 		 177 aa  96.3  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.904842  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1901  colicin V production protein  49.65 
 
 		 186 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1154  Colicin V production protein  42.07 
 
 		 162 aa  94.7  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.418061  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1051  colicin V production protein  42.68 
 
 		 184 aa  94  9e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0960  colicin V production protein  42.68 
 
 		 184 aa  94  9e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0660005  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1044  Colicin V production protein  36.36 
 
 		 188 aa  90.5  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.572812 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2300  colicin V production protein  38.35 
 
 		 171 aa  87  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113958  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1799  colicin V production protein  37.5 
 
 		 187 aa  85.9  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503822  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1672  colicin V production protein  40.28 
 
 		 163 aa  85.1  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1241  colicin V production protein  33.33 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.599135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2461  colicin V production protein  36.84 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.400499  normal  0.228634 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2875  putative bacteriocin production related protein  37.14 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4616  colicin V production protein  35.71 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2065  CvpA family protein  34.78 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1693  colicin V production protein  38.18 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.339173 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1723  Colicin V production protein  34.78 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.558498  normal  0.0591031 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0777  colicin V production protein  37.68 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136777  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2283  colicin V production protein  32.62 
 
 		 213 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4770  colicin V production protein  30.43 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161022 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2310  colicin V production protein  27.61 
 
 		 191 aa  70.5  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2453  colicin V production protein  33.57 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6836  Colicin V production protein  36.43 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612916 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0404  colicin V production protein  34.57 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1091  colicin V production protein  32.61 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.527466 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3788  putative colicin V production protein, cvpA-like (dedE protein) (Pur regulon 18 kDa protein)  29.08 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2996  colicin V production protein  32.31 
 
 		 210 aa  67.4  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2016  colicin V production protein  31.54 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.535943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1907  colicin V production protein  32.47 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2292  colicin V production protein  32.31 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3500  Colicin V production protein  31.91 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0487  CvpA protein  27.94 
 
 		 187 aa  64.3  0.0000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.457709  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2152  colicin V production protein  31.11 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.925685  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4380  colicin V production protein  35 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4403  colicin V production protein  36.19 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.454399  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3964  colicin V production protein  36.19 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>