13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2038 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01391  predicted benzoate transporter  98.83 
 
 		 1176 bp  1602    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2213  benzoate transporter  98.83 
 
 		 1176 bp  1602    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.8089  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1518  benzoate transporter  98.83 
 
 		 1269 bp  1602    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1612  benzoate transporter  99.3 
 
 		 1269 bp  1633    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.795088  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2226  benzoate transporter  98.83 
 
 		 1176 bp  1602    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.711061 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1742  benzoate transporter  97.89 
 
 		 993 bp  1538    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000016088  hitchhiker  2.5530700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2038    100 
 
 		 852 bp  1689    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000010196  hitchhiker  2.0224999999999997e-21 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01401  hypothetical protein  98.83 
 
 		 1176 bp  1602    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1723  benzoate transporter  100 
 
 		 1179 bp  58  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.26811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1720  benzoate transporter  100 
 
 		 1179 bp  52  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1784    100 
 
 		 1179 bp  52  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1555  benzoate transporter  100 
 
 		 1179 bp  52  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1736  benzoate transporter  100 
 
 		 1179 bp  52  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>