25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_02505 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1058  SmpA/OmlA domain protein  100 
 
 		 113 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.276511  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02469  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.10509  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3857  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00570631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1067  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261293  normal  0.540177 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2901  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.301484  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2775  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494062  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2769  hypothetical protein  98 
 
 		 113 aa  106  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0179366  normal  0.124588 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02505  small membrane lipoprotein  100 
 
 		 50 aa  104  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.122436  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3006  hypothetical protein  96 
 
 		 113 aa  104  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00281492  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3097  hypothetical protein  97.92 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.525418  normal  0.376087 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2898  hypothetical protein  93.75 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2900  hypothetical protein  93.75 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.748981 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2880  hypothetical protein  93.75 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.183731 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2830  hypothetical protein  93.75 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.015187  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3012  hypothetical protein  93.75 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3219  hypothetical protein  85.11 
 
 		 112 aa  90.5  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1375  hypothetical protein  78 
 
 		 113 aa  90.1  8e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233732  normal  0.0312807 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2977  hypothetical protein  78 
 
 		 113 aa  90.1  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140554  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3687  hypothetical protein  81.25 
 
 		 112 aa  89.7  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0028904  normal  0.0506936 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2890  hypothetical protein  76 
 
 		 113 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000014061  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0727  hypothetical protein  82.98 
 
 		 111 aa  87.4  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.405452  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0962  hypothetical protein  80.85 
 
 		 111 aa  87  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.719201  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3299  hypothetical protein  71.43 
 
 		 114 aa  84.7  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0566  small protein A  48.57 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.183668  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0227  small protein A  36.96 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>