26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2916 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2916  flagellar biosynthesis protein, FliO, putative  100 
 
 
173 aa  349  8.999999999999999e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.465826  normal  0.367308 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0376  flagellar biosynthesis protein FliO  63.81 
 
 
217 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2214  flagellar biosynthesis protein FliO  57.98 
 
 
191 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3584  flagellar biosynthesis protein, FliO, putative  45.28 
 
 
168 aa  93.6  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.621138  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2732  flagellar biosynthesis protein FliO  50.75 
 
 
118 aa  62.4  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1167  flagellar biogenesis protein FliO  41.33 
 
 
129 aa  58.2  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0709  flagellar biosynthetic protein FliO  33.33 
 
 
211 aa  53.1  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.942573  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2141  flagellar biosynthesis protein FliO  30.48 
 
 
125 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267968 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1264  flagellar biosynthesis protein FliO  30.48 
 
 
125 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1141  flagellar biosynthesis protein FliO  30.48 
 
 
125 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0496709  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2136  flagellar biosynthesis protein FliO  30.48 
 
 
125 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.206958 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2194  flagellar biosynthesis protein FliO  30.48 
 
 
125 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.805426 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24140  Flagellar biosynthesis protein  40.7 
 
 
140 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.452089  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2584  flagellar biosynthesis protein FliO  33.33 
 
 
140 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1882  flagellar biosynthetic protein FliO  30.3 
 
 
140 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002824  flagellar biosynthesis protein FliO  26.73 
 
 
137 aa  44.3  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2401  flagellar biosynthesis protein FliO  37.63 
 
 
178 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1678  hypothetical protein  29.63 
 
 
125 aa  43.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2301  flagellar protein fliO  37.63 
 
 
178 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2538  flagellar biosynthesis protein FliO  32.11 
 
 
124 aa  43.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.600463  normal  0.973594 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2288  flagellar protein FliO  33.33 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.667143  normal  0.915972 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0864  hypothetical protein  29.9 
 
 
210 aa  42.7  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1375  flagellar biosynthesis protein, FliO  30 
 
 
125 aa  42  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.679292  normal  0.145211 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0856  hypothetical protein  50 
 
 
139 aa  42  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0878754  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1964  flagellar biosynthesis protein, FliO  34.18 
 
 
163 aa  42  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1370  flagellar biosynthesis protein FliO  34.85 
 
 
124 aa  41.2  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>