19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1429 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1429  TRASH domain-containing protein  100 
 
 		 99 aa  202  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1968  TRASH  60 
 
 		 100 aa  137  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0363  TRASH domain protein  71.11 
 
 		 98 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00964883 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1187  TRASH domain-containing protein  58.59 
 
 		 97 aa  123  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.254659  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1349  TRASH domain protein  43.21 
 
 		 88 aa  87  8e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.407824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1455  TRASH  43.9 
 
 		 83 aa  77.4  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00129945  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2978  hypothetical protein  36.9 
 
 		 82 aa  50.8  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.48983  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0052  TRASH domain-containing protein  36.67 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0704  hypothetical protein  35.29 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0623  TRASH domain protein  32.91 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.34319e-36 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3019  permease  34.94 
 
 		 463 aa  45.1  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0295  TRASH domain-containing protein  34.07 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0609  TRASH domain protein  31.17 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3533  heavy metal translocating P-type ATPase  36.36 
 
 		 786 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0528  hypothetical protein  44.9 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.719043  normal  0.638753 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4609  heavy metal translocating P-type ATPase  36.36 
 
 		 786 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0496  hypothetical protein  31.4 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0572  hypothetical protein  42.86 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0374  hypothetical protein  28.57 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.72923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>