22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0371 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0371  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  535  1e-151  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0068  protein of unknown function DUF692  32.11 
 
 
282 aa  59.7  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002084  hypothetical protein  29.32 
 
 
289 aa  56.2  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4348  hypothetical protein  37.66 
 
 
318 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00353  hypothetical protein  27.82 
 
 
308 aa  53.9  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2831  hypothetical protein  30.84 
 
 
301 aa  52  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0028  hypothetical protein  32.88 
 
 
283 aa  48.9  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1533  hypothetical protein  37.62 
 
 
283 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0031  hypothetical protein  37.62 
 
 
283 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0031  hypothetical protein  37.62 
 
 
283 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0045  hypothetical protein  37.62 
 
 
283 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1458  hypothetical protein  37.62 
 
 
283 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1178  hypothetical protein  37.62 
 
 
283 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0025  hypothetical protein  37.62 
 
 
283 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4384  hypothetical protein  24.69 
 
 
300 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0181481 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4775  hypothetical protein  24.69 
 
 
290 aa  47.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0120  hypothetical protein  22.83 
 
 
290 aa  46.2  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2003  hypothetical protein  30 
 
 
277 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.912952  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3694  hypothetical protein  26.72 
 
 
279 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0410237 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4400  hypothetical protein  38.36 
 
 
278 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3094  hypothetical protein  22.79 
 
 
277 aa  42.4  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3297  hypothetical protein  33.33 
 
 
277 aa  42  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.867164 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>