26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2267 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2267  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  100 
 
 
344 aa  697    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0191  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  63.19 
 
 
383 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224134  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0064  hypothetical protein  63.07 
 
 
281 aa  330  3e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0042  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  55.74 
 
 
291 aa  287  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2241  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  43.61 
 
 
248 aa  211  2e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0213  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  39.9 
 
 
245 aa  187  2e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3438  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  34.86 
 
 
246 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425893 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07971  putative carboxypeptidase  34.91 
 
 
210 aa  60.1  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.999242 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1241  putative carboxypeptidase  33.02 
 
 
250 aa  59.7  0.00000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0165  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  33.96 
 
 
236 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.132587  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16751  putative carboxypeptidase  33.96 
 
 
243 aa  57  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1196  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  31.78 
 
 
244 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206054 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4445  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  31.73 
 
 
284 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.585911  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1238  putative carboxypeptidase  33.02 
 
 
267 aa  54.3  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.588362  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10021  putative carboxypeptidase  33.01 
 
 
248 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.127155 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1672  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  35.51 
 
 
241 aa  52  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3932  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  29.29 
 
 
264 aa  50.4  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3580  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  30 
 
 
269 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2828  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  31.31 
 
 
246 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3270  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  31.31 
 
 
246 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.885024  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08231  putative carboxypeptidase  31.68 
 
 
237 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0769  putative carboxypeptidase  30.69 
 
 
237 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08211  putative carboxypeptidase  30.1 
 
 
182 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08221  putative carboxypeptidase  31.68 
 
 
243 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04455  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family  34.43 
 
 
265 aa  43.9  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2421  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  29.46 
 
 
273 aa  43.5  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>