19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2166 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2166  protein of unknown function DUF169  100 
 
 
281 aa  590  1e-168  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0320  protein of unknown function DUF169  64.36 
 
 
284 aa  382  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.129666  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1444  protein of unknown function DUF169  53.43 
 
 
281 aa  304  8.000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2491  hypothetical protein  48.91 
 
 
296 aa  286  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.785012  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2533  hypothetical protein  43.8 
 
 
285 aa  226  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0915  hypothetical protein  34.12 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.155446  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1527  hypothetical protein  29.17 
 
 
250 aa  102  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1649  hypothetical protein  36 
 
 
274 aa  93.6  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.140534  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0116  protein of unknown function DUF169  36.55 
 
 
265 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011799  hitchhiker  0.00705283 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0039  hypothetical protein  33.15 
 
 
267 aa  90.5  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3174  hypothetical protein  31.13 
 
 
273 aa  77  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2252  protein of unknown function DUF169  24.62 
 
 
238 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1376  hypothetical protein  31.13 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59451  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2893  hypothetical protein  29.22 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.362582  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1049  hypothetical protein  30.52 
 
 
232 aa  66.6  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.931099  normal  0.654081 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0332  hypothetical protein  23.05 
 
 
278 aa  66.6  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2481  hypothetical protein  23.02 
 
 
274 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.287343 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2260  hypothetical protein  25.11 
 
 
279 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.087732 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0407  hypothetical protein  19.87 
 
 
279 aa  52.8  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>