19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2520 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2520  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  136  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0347554 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0427  hypothetical protein  38.89 
 
 		 83 aa  50.4  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6176  hypothetical protein  40.3 
 
 		 71 aa  50.1  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.727452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1784  hypothetical protein  47.69 
 
 		 64 aa  48.9  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.727128 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2053  hypothetical protein  40.3 
 
 		 62 aa  47.4  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.920599  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1281  conserved hypothetical secreted protein  40.3 
 
 		 62 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0914  hypothetical protein  41.54 
 
 		 64 aa  45.4  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0164503  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1457  hypothetical protein  36.23 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.101741  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1261  hypothetical protein  37.31 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.56018 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0981  hypothetical protein  45.71 
 
 		 61 aa  44.7  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.995934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1159  hypothetical protein  38.81 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.136303 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1244  hypothetical protein  40 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.822358  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0684  hypothetical protein  39.71 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.367344 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4302  hypothetical protein  37.31 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386167  normal  0.0304485 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2197  hypothetical protein  38.81 
 
 		 70 aa  41.2  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1499  hypothetical protein  34.33 
 
 		 68 aa  40.8  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1611  hypothetical protein  37.31 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.931765  normal  0.039874 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2964  hypothetical protein  37.31 
 
 		 70 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224822  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1478  hypothetical protein  34.29 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>