26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2128 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2128  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  306  1.0000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.401537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1783  paraquat-inducible protein A  59.86 
 
 		 162 aa  157  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.266349 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1065  paraquat-inducible protein A  59.52 
 
 		 141 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.106093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2457  hypothetical protein  61.9 
 
 		 141 aa  132  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0535929  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1120  paraquat-inducible protein A  62.2 
 
 		 141 aa  132  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.167662  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1714  paraquat-inducible protein A  54.48 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.400974  normal  0.677106 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1153  paraquat-inducible protein A  31.13 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136133  normal  0.393149 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2403  PqiA family integral membrane protein  33.98 
 
 		 427 aa  44.3  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5823  paraquat-inducible protein A  35.43 
 
 		 401 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.166267  normal  0.696161 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0482  paraquat-inducible protein A  32.32 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2101  integral membrane protein, PqiA family  33.01 
 
 		 427 aa  42  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268144  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1987  integral membrane protein PqiA family  31.07 
 
 		 427 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.04812  hitchhiker  0.00476807 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2049  hypothetical protein  31.07 
 
 		 427 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1991  integral membrane protein, PqiA family  31.07 
 
 		 427 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.227718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1283  integral membrane protein, PqiA family  31.07 
 
 		 427 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000216228  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1467  PqiA family integral membrane protein  31.07 
 
 		 427 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00123019  normal  0.152719 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2566  integral membrane protein, PqiA family  32.04 
 
 		 427 aa  41.6  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390803  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01804  conserved inner membrane protein  32.04 
 
 		 427 aa  41.6  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01792  hypothetical protein  32.04 
 
 		 427 aa  41.6  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1354  PqiA family integral membrane protein  32.04 
 
 		 412 aa  41.6  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000343828  normal  0.147943 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1799  PqiA family integral membrane protein  32.04 
 
 		 427 aa  41.6  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.617144  normal  0.0501575 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2062  PqiA family integral membrane protein  32.04 
 
 		 427 aa  41.6  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000156697  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1924  PqiA family integral membrane protein  32.04 
 
 		 427 aa  41.6  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171721  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1809  integral membrane protein, PqiA family  32.04 
 
 		 427 aa  41.6  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0039  putative paraquat-inducible protein  32.12 
 
 		 220 aa  41.2  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.355976  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4781  paraquat-inducible protein A  28.57 
 
 		 207 aa  40.4  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611001 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>