21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1098 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1098  protein of unknown function DUF456  100 
 
 
168 aa  311  2.9999999999999996e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0512381 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0940  protein of unknown function DUF456  50.89 
 
 
200 aa  150  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0261  protein of unknown function DUF456  42.41 
 
 
168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1154  protein of unknown function DUF456  44.44 
 
 
169 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.147435 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0570  hypothetical protein  44.71 
 
 
169 aa  97.8  7e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0973  hypothetical protein  44.91 
 
 
168 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2010  hypothetical protein  38.95 
 
 
159 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000106435  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04813  hypothetical protein  33.33 
 
 
161 aa  57.4  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1447  hypothetical protein  37.29 
 
 
165 aa  53.9  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.704764  normal  0.137111 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1793  hypothetical protein  36 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0075  protein of unknown function DUF456  36.25 
 
 
160 aa  51.6  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0886  hypothetical protein  32.95 
 
 
159 aa  50.1  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1610  hypothetical protein  41.86 
 
 
159 aa  49.3  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.148481  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1181  hypothetical protein  34.04 
 
 
161 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0330  hypothetical protein  22.95 
 
 
162 aa  45.8  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1263  protein of unknown function DUF456  31.65 
 
 
172 aa  44.7  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2530  protein of unknown function DUF456  34.02 
 
 
157 aa  43.9  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1382  hypothetical protein  30.53 
 
 
154 aa  43.9  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.764083  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2882  protein of unknown function DUF456  33.04 
 
 
159 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0019277  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0954  protein of unknown function DUF456  30.91 
 
 
161 aa  42  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00446905  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0973  protein of unknown function DUF456  32.12 
 
 
161 aa  40.8  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.344624 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>