47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1597 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1597  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.42174  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2417  sporulation protein YtaF  60.19 
 
 
217 aa  241  5e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0244872 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2015  integral membrane protein  39.91 
 
 
211 aa  157  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4415  sporulation protein YtaF  40.95 
 
 
210 aa  155  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0770529  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4480  hypothetical protein  40.48 
 
 
210 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4315  hypothetical protein  40.48 
 
 
210 aa  155  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0571925  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4829  hypothetical protein  40.48 
 
 
210 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0019302  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4700  hypothetical protein  40.48 
 
 
210 aa  155  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2037999999999999e-32 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4716  hypothetical protein  40.48 
 
 
210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0544863  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4695  hypothetical protein  40.48 
 
 
210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000269761  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4710  hypothetical protein  40.48 
 
 
210 aa  155  6e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0031753  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4326  hypothetical protein  40.48 
 
 
210 aa  154  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0543  hypothetical protein  40.95 
 
 
210 aa  154  7e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0110551  hitchhiker  1.13308e-16 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3270  sporulation protein YtaF  39.23 
 
 
210 aa  149  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000294691  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1405  hypothetical protein  42.45 
 
 
203 aa  148  5e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.27094  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1890  sporulation protein YtaF  40.28 
 
 
207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0184  sporulation protein YtaF  37.96 
 
 
222 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1839  integral membrane protein  41.43 
 
 
207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.167157  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2471  sporulation protein YtaF  35.98 
 
 
218 aa  116  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193176  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1069  sporulation protein YtaF  30.95 
 
 
212 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04880  Sporulation protein YtaF  35.32 
 
 
219 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000954783  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0414  sporulation protein YtaF  31.25 
 
 
203 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0550  hypothetical protein  30.77 
 
 
203 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0499  hypothetical protein  31.25 
 
 
203 aa  98.2  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0469  hypothetical protein  30.77 
 
 
203 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0495  hypothetical protein  30.77 
 
 
203 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.207406  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0477  hypothetical protein  30.77 
 
 
203 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0412  integral membrane protein  30.77 
 
 
203 aa  96.7  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0234024  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0550  hypothetical protein  30.77 
 
 
203 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000729048  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4823  hypothetical protein  31.25 
 
 
203 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00678439  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0408  integral membrane protein  30.29 
 
 
203 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3212  protein of unknown function DUF204  27.01 
 
 
207 aa  95.5  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000348799  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0955  hypothetical protein  31.96 
 
 
209 aa  90.1  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0423  sporulation protein YtaF  31.44 
 
 
202 aa  89.7  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000363461  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0432  protein of unknown function DUF204  30.52 
 
 
208 aa  89.7  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1956  hypothetical protein  30.93 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0197086  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1267  hypothetical protein  27.47 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0859395  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2396  hypothetical protein  29.03 
 
 
213 aa  65.1  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.104879  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2330  putative sporulation protein YtaF  28.57 
 
 
202 aa  59.3  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.235045  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2044  putative sporulation protein YtaF  28.57 
 
 
202 aa  58.5  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0455  hypothetical protein  25.12 
 
 
201 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.703448 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1700  protein of unknown function DUF204  29.59 
 
 
188 aa  48.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000050274  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0597  putative sporulation protein YtaF  29.35 
 
 
180 aa  47  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000714845  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2522  protein of unknown function DUF204  30.53 
 
 
187 aa  46.2  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0555852 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0503  hypothetical protein  23.68 
 
 
213 aa  45.4  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0516  hypothetical protein  23.68 
 
 
213 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3165  hypothetical protein  35.56 
 
 
180 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000676254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>