10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0027 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0027  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  659    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242555  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2240  hypothetical protein  28.7 
 
 		 330 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1324  membrane protein  26.82 
 
 		 342 aa  105  9e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0232  hypothetical protein  25.98 
 
 		 327 aa  98.6  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1734  hypothetical protein  28 
 
 		 327 aa  90.5  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00489237  normal  0.395653 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0744  hypothetical protein  28.03 
 
 		 318 aa  89.7  6e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0745466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1133  hypothetical protein  26.21 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128291 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0853  hypothetical protein  24.34 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.875344  normal  0.548641 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3557  hypothetical protein  24.06 
 
 		 340 aa  76.3  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2084  transcriptional regulator, TrmB  39.13 
 
 		 111 aa  43.9  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>