9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2240 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2240  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  652    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1133  hypothetical protein  36.9 
 
 		 330 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128291 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1734  hypothetical protein  37.65 
 
 		 327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00489237  normal  0.395653 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3557  hypothetical protein  36.71 
 
 		 340 aa  143  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0232  hypothetical protein  32.23 
 
 		 327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0027  hypothetical protein  28.7 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242555  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0744  hypothetical protein  29.84 
 
 		 318 aa  105  9e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0745466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0853  hypothetical protein  32.01 
 
 		 329 aa  100  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.875344  normal  0.548641 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1324  membrane protein  26.16 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>