9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_R0039 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_R0039  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189682  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0034  tRNA-Gln  92.65 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.144366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0010  tRNA-Gln  93.75 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.505008  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0028  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0390985  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0012  tRNA-Gln  91.3 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0003  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0036  tRNA-Gln  84.06 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0103538  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0032  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0057  tRNA-Gln  83.1 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>