15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2597 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2597  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 270 aa  548  1e-155  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1499  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.91 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1076  hypothetical protein  29.77 
 
 		 280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1270  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.03 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1123  xylose isomerase domain-containing protein  28.85 
 
 		 269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0449759  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1262  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.15 
 
 		 267 aa  107  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1072  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.79 
 
 		 264 aa  105  9e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1679  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.33 
 
 		 271 aa  104  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.917084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1134  hypothetical protein  25.38 
 
 		 268 aa  94  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.61666  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1756  hypothetical protein  27.27 
 
 		 271 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3496  hypothetical protein  31.02 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2481  hypothetical protein  26.71 
 
 		 255 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1367  hypothetical protein  23.33 
 
 		 220 aa  50.4  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3122  hypothetical protein  32.98 
 
 		 204 aa  48.5  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0856  hypothetical protein  39.71 
 
 		 205 aa  44.3  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>