19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1095 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1095  NERD domain-containing protein  100 
 
 		 254 aa  521  1e-147  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00991797  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2685  NERD domain-containing protein  51.2 
 
 		 255 aa  255  4e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00601782  normal  0.186015 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3235  NERD domain protein  37.05 
 
 		 254 aa  192  4e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000235763  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3609  hypothetical protein  29.84 
 
 		 321 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0788453  normal  0.035398 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3673  hypothetical protein  29.41 
 
 		 304 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3140  hypothetical protein  25.29 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.347531  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0627  hypothetical protein  24.71 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3326  hypothetical protein  29.19 
 
 		 308 aa  82  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2107  NERD domain protein  25.19 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.661217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2121  hypothetical protein  25.19 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.608641  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2238  hypothetical protein  25.77 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.578403  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2354  NERD domain-containing protein  25.19 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.941853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0264  hypothetical protein  31.88 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.8207  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1330  NERD domain protein  26.25 
 
 		 540 aa  52.4  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0849  NERD domain protein  27.01 
 
 		 286 aa  52  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3808  hypothetical protein  44.23 
 
 		 331 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2293  NERD domain protein  28.57 
 
 		 216 aa  43.5  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7299  NERD domain-containing protein  28.72 
 
 		 263 aa  42  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0313277 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4510  hypothetical protein  32.88 
 
 		 263 aa  42.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>