20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_996 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_996  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  359  1e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1023  hypothetical protein  82.7 
 
 
198 aa  300  6.000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1213  hypothetical protein  81.08 
 
 
185 aa  300  1e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00201716  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1030  hypothetical protein  33.55 
 
 
215 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0209  hypothetical protein  28.74 
 
 
176 aa  59.3  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0691804  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0049  protein of unknown function DUF95 transmembrane  35.94 
 
 
191 aa  55.8  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000020033  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2368  protein of unknown function DUF95 transmembrane  31.55 
 
 
211 aa  53.9  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1639  hypothetical protein  32.35 
 
 
193 aa  53.1  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0527  hypothetical protein  26.19 
 
 
175 aa  52.4  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.917829  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3166  protein of unknown function DUF95 transmembrane  37.19 
 
 
509 aa  51.2  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1138  hypothetical protein  29.44 
 
 
189 aa  50.1  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1427  protein of unknown function DUF95 transmembrane  31.73 
 
 
511 aa  46.2  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1756  protein of unknown function DUF95 transmembrane  31.87 
 
 
197 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000547169  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0346  protein of unknown function DUF95 transmembrane  33.33 
 
 
528 aa  46.6  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.160239 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0289  integral membrane protein  34.48 
 
 
246 aa  45.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271645  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1962  hypothetical protein  36.08 
 
 
197 aa  46.2  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.923141 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0532  hypothetical protein  28.16 
 
 
188 aa  44.7  0.0008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0524  hypothetical protein  27.07 
 
 
181 aa  43.9  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.202307  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0946  protein of unknown function DUF95 transmembrane  29.83 
 
 
188 aa  43.5  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.886954  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0908  hypothetical protein  29.55 
 
 
196 aa  43.5  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>